Portfel EUDI został zaprojektowany w taki sposób, aby ochrona danych nie opierała się wyłącznie na zaufaniu, ale była zabezpieczona mechanizmami technicznymi. Celem jest zapewnienie, że użytkownicy udostępniają tylko te informacje, które są rzeczywiście wymagane w konkretnym przypadku użycia.

W tym celu wykorzystywane są nowoczesne metody kryptograficzne, takie jak dowody zerowej wiedzy. Przykładowo, możliwe jest udowodnienie, że dana osoba ukończyła 18 lat bez ujawniania jej faktycznej daty urodzenia. Usługa otrzymuje jedynie wymagany dowód, ale nie podstawowe dane osobowe.

W wielu przypadkach oryginalne dane pozostają w portfelu EUDI na urządzeniu użytkownika. Platforma wnioskująca ma jedynie techniczny dostęp do informacji, które zostały wyraźnie autoryzowane.

W rezultacie portfel EUDI oferuje nie tylko organizacyjne środki ochrony danych, ale także gwarancje techniczne, które utrudniają nadmierne gromadzenie danych i profilowanie.