Peněženka EUDI je navržena tak, aby ochrana údajů nebyla založena pouze na důvěře, ale byla zajištěna technickými mechanismy. Cílem je zajistit, aby uživatelé sdíleli pouze ty informace, které jsou skutečně potřebné pro konkrétní případ použití.

K tomuto účelu se používají moderní kryptografické metody, jako jsou důkazy nulové znalosti. Například je možné dokázat, že osoba je starší 18 let, aniž by bylo nutné prozradit její skutečné datum narození. Služba obdrží pouze požadovaný důkaz, nikoli však základní osobní údaje.

V mnoha případech použití zůstávají původní data v peněžence EUDI v zařízení uživatele. Žádající platforma má technický přístup pouze k informacím, které byly výslovně autorizovány.

Peněženka EUDI proto nabízí nejen organizační opatření na ochranu údajů, ale také technické záruky, které ztěžují nadměrné shromažďování údajů a profilování.